GİST tümörlerinde son yıllarda birbirinden farklı mekanizmalarla oldukça başarılı sonuçlar sununa yenilikçi akıllı tedavi seçenekleri ortaya çıkmıştır. Bu tedavilerin belirlenmesi için ilgili hedefleyici mutasyonların tespiti gerekmetedir. Gerek tedavi başlangıcında gerekse tedavi direncinde kapsamlı genetik analizler önerilmektedir.